根据全民健康保障信息化一期工程-疾病预防控制信息系统集成项目推进要求，艾滋病防治基本信息系统的感染者随访和抗病毒治疗信息模块及相应的权限管理模块已迁移至新系统，经过前期开发、测试与培训，相关功能于2021年7月7日在全民健康保障信息化工程中国疾病预防控制信息系统应用门户正式上线运行。原艾滋病感染者随访和抗病毒治疗信息模块及相应的权限管理功能于2021年6月30日停止运行。

本次升级主要包括感染者随访和抗病毒治疗的病例个案表格更新、填报模块变更、统计分析报表模块调整、用户授权和历史数据迁移等。不涉及“检测份数表”、“高危行为干预”和“新发感染检测”等信息模块，相关的数据填报、管理工作仍照现有模式运行。

新系统上线之初，存在颇多问题。尤其是治疗数据与传报卡的一对一关联，上线后新入组治疗的病人需先查到传报卡信息方可追加治疗信息，而历史治疗数据会在数据迁移过程中根据身份识别信息与传报卡进行一对一精准关联。关联不成功的历史治疗数据需上线后在新系统下尽快手动查询、订正，尽早关联。为此性艾科相关人员，将全市需要手动关联的200多条数据分至各个辖市区，并指导督促其尽快完成关联工作。